Az öttagú nemzetközi zsűri a fesztivál nagydíját, az Arany Benjámint Kocsis Ágnes "Friss levegő" című filmjének ítélte. A Geller Szabolcs - Malovecz Ildikó alkotta szobrot 5000 euró pénzjutalommal együtt adták át. A nemzetközi zsűri döntése értelmében a Filmünnep operatőri díját Simon Tanšek kapta a "Sírugrók" című film fényképezéséért. A legjobb színész díját Gregor Baković kapta a "Sírugrók" című filmben nyújtott alakításáért, míg a legjobb női előadásért Ioana Barbut tüntették ki. 

A 2. Pécsi Nemzetközi Filmünnep diákzsűrije Jan Hryniak moziját, a "Harmadik" című filmet tüntette ki, míg a Közönségdíjat Jan Cvitkovic "Sírugrók" c. filmje érdemelte ki. A Nemzetközi Filmkritikusok díját Ognjen Sivilicic "Bocs a Kung fuért" c. filmje kapta, míg a Duna TV különdíját Radoslav Spassov "Ellopott szemek" c. mozijának nyújtották át. A Sláger Rádió különdíját „A metróból szeretettel” című mű kapta.

A 2006. október 2-7. között megtartott Filmünnep hat napján, hat különböző helyszínen 14 ország nagyjátékfilmjei mérettették meg magukat. Összesen 40 nagyjátékfilmet mutattak be mintegy 90 vetítésen, a rendezvényen 135 kísérőprogramot rendeztek. Összesen mintegy húszezren vettek részt a Filmünnep rendezvényein; ez a tavalyi rendezvény látogatószámának a háromszorosa.