A cefalosporinokat széles körben használják tüdőgyulladás kezelésére az embereknél, de alkalmas a bőrt- és a szöveteket érintő fertőzések gyógyítására, csakúgy mint a szalmonella vagy épp az E.coli ellen is.

Tudósok szerint ezen antibiotikumok túlzott használata a baktériumok gyógyszerellenállásához vezethetnek, mert dominánssá válnak a rezisztens törzsek. A legismertebb antibiotikum-ellenálló baktérium, az úgynevezett szuperbaktérium, az MRSA (meticillin-rezisztens Staphylococcus aureus).

Az állattenyésztők szerint viszont az antibiotikumok egészségesen tartják a jószágokat, és a szerek alkalmazása nem kapcsolható közvetlenül az emberi szervezetben megjelenő kórokozók gyógyszerellenállásának kialakulásához.

Az FDA rendelkezése értelmében a cefalosporinokat a jövőben csak beteg állatoknál és csak jóváhagyott mennyiségben lehet alkalmazni. A döntés nem vonatkozik a cefapirin nevű régebbi szerre, amely az antibiotikumok érintett csoportjába tartozik ugyan, de nem vezet gyógyszerrezisztenciához az embereknél.

A hatóság már 2008-ban javasolta a cefalosporinok korlátozását, de akkor visszavonta erre irányuló javaslatát, arra hivatkozva, hogy szélesebb körű kutatásokra és bizonyítékokra van szüksége. Az FDA korábban szigorította egy másik antibiotikumcsalád, a cipro nevű szert is magában foglaló fluoroquinolonok használatát - a lépés kulcsfontosságú volt a 2001-es lépfenetámadásokra való reagálásban az Egyesült Államokban.