Rachmat Witolear szerint a fajok eltűnése "kárt okoz a természet egyensúlyában" és "veszélyezteti az élelmiszerellátás biztonságát" .

A klímaváltozás is rontott az Indonéziában élő főemlősök helyzetén, de a legnagyobb veszélyt az jelenti, hogy - az ellenőrizetlen gazdasági fejlődés, a lakosság számának növekedése, a termőföldek növelése, az ásványi és erdészeti kincsek kiaknázása miatt - egyre gyorsabb ütemben irtják az erdőt.

Indonéziában irtották ki a legtöbb erdőt a világon 2000 és 2005 között, évente több mint egy millió hektárnyit, óránként háromszáz futballpályányit.

A Nemzetközi Természetvédelmi Szövetség (IUCN) szerint az Indonéziában élő 3700 állatfajának 19 százaléka valamilyen mértékben veszélyeztetett.

Indonéziában él a világ tengeri állatainak a legtöbb faja, és Brazília után itt él a legtöbb szárazföldi állatfaj.