A korábbi kiváló középpályás az anabolikus szteroidok közé tartozó nandrolon nevű szerrel bukott le, amiért négy hónapra szóló eltiltást kapott. Guardiola végig tagadta bűnösségét, 2006-ban pedig egy olasz bíróság felmentette.

A CONI azonnal tiltakozott az ítélet ellen, idén júliusban pedig a doppingellenes bizottság újra elővette az ügyet, melyet szeptember 15-én tárgyaltak, s mostanra született ítélet. "Végre lezárult ez az ügy, és nyugodtan nézhetek előre" - nyilatkozta a szakember csapata keddi, a Dinamo Kijev ellen 2-0-ra megnyert Bajnokok Ligája-mérkőzését követően.