Ez az igazgatóság központosított ellenőrzést végezhet, kezdeményezhet, s magához vonhat ügyeket (nemzetközi ügyek, kapcsolt vállalkozások, színlelt
szerződések), egyes esetekben pedig kizárólagos illetékessége lesz. Jövőre az APEH-ba integrálódnak az illetékhivatalok. Az adóhatóság arra törekszik, hogy az ügyfelek ne érzékeljék az átalakulást, ezért szeretnék az ügyfélszolgálati tevékenységet minél gyorsabban integrálni. Az APEH 2008-ra szeretne egységes illetékeljárást kialakítani.  
   
Az adóhivatalba integrálódik a Szerencsejáték Felügyelet is. Ennek kapcsán az adóhatóságnak olyan sajátos feladatoknak kell majd megfelelnie, mint a játékosok védelme, a koncessziós tevékenység vagy például a szabálysértési eljárások lefolytatása. A jövő évtől az adóhatósághoz érkeznek a foglalkoztatotti bejelentések is. Az APEH haladéktalanul feldolgozza a bejelentéseket és naponta akár többször átküldi elektronikusan az adatokat az
OEP-hez és az OMMF-hez - ígérte az elnökhelyettes.
   
A magánnyugdíjpénztári bevallásokat és befizetéseket is az APEH fogadja majd a jövő évtől. Ez a változás Juhász István szerint a munkáltatóknak és a pénztáraknak nagy könnyebbséget, az adóhivatalnak pedig kicsivel több munkát jelent. A pénztári befizetéseket nem lehet majd más adószámlára átvezetni, de a tévesen pénztári számlára utalt adót visszaveszik majd. Bár szó volt róla, nem szűnt meg az ADAM, vagyis az adóhatósági adómegállapítás, csak a munkáltatói adóelszámolás. A munkáltatók azért nem maradtak feladat nélkül, ugyanis nekik kell majd a nyilatkozatokat átvenniük és továbbítani az adóhatósághoz - derült ki. 
   
A szokásos piaci ár hatósági megállapítása is az adóhivatalnál kötött ki végül, bár sokáig úgy volt, ez a Pénzügyminisztérium feladata lesz. Az APEH egyeztet majd a külföldi adóhatóságokkal.