A rektori posztra hárman pályáztak: Fábián István jelenlegi rektor, Szilvássy Zoltán stratégiai rektorhelyettes és Paragh György, az egyetem orvostudományi centrumának elnöke. Az egyetem szenátusa az első szavazáskor Paragh Györgyöt sorolta az első helyre, másodikként Fábián Istvánt, harmadikként Szilvássy Zoltánt jelölte.

Ezután meglepő fordulat történt, bár az MTI információi szerint az első és a második helyre sorolt professzorok között csak néhány szavazatnyi különbség volt, Fábián István jelenlegi rektor visszalépett a jelöléstől. Az egyetem szóvivője szerint a jelenlegi rektor azért választotta ezt a megoldást, hogy egyértelmű támogatottságú jelöltet terjeszthessenek elő a fenntartónak.

A második fordulóban a szenátus meggyőző többséggel támogatta Paragh György rektori jelölését - tette hozzá Szöőr Ádám. A szenátusi sorrend egyébként nem köti a fenntartót, a két jelölt közül Balog Zoltán, az emberi erőforrások minisztere dönti el, kit terjeszt fel kinevezésre a köztársasági elnöknek. Az új rektor július 1-jén állhat munkába, megbízatása négy évre szól majd.