Hónapokra elvesztek a nukleáris fegyverek indítókódjai Clinton elnöksége idején.Shelton a Without Hesitation (Habozás nélkül) című könyvében az állítja, hogy a kódokat az elnök egyik közeli, meg nem nevezett munkatársa vesztette el. Az incidens a tábornok szerint 2000 körül történt. A kódokat a biztonsági szabályok értelmében minden hónapban ellenőrizték azok letéteményesénél és a rakéták indítását jóváhagyó jelkombinációt minden negyedik hónapban lecserélték. 

Az elnöki asszisztens egy alaklommal azt mondta az ellenőrzésre kiérkezett hivatalos személynek, hogy a kódokat az elnök magához vette, de fontos tárgyalása van, ezért nem lehet zavarni. Egy hónappal később egy másik ellenőrnek a kód őrzője ugyanazt a történetet adta elő. Az illető csak akkor vallotta be, hogy már hónapokkal korábban elveszítette a kombinációkat, amikor elérkezett a csere ideje. A kódokat azonnal lecserélték és az incidenssel kapcsolatban vizsgálatot indítottak. 

A tábornok szerint Clinon elnök sohasem tartotta magánál a kódokat, s nem volt tudomása róla, hogy az asszisztense elvesztette őket. Shelton emlékirataiban "a tévedések vígjátékának" nevezte az esetet.