Hodorkovszkijt és Lebegyevet többéves szibériai büntetőtábor és ezen belül kétévi vizsgálati fogság után februárban szállították egy moszkvai vizsgálati fogházba, mivel március 3-án megkezdődött ellenük a második per. Oroszország egykori leggazdagabb emberét és üzlettársát először kétévi vizsgálati fogság után, egyebek között csalás és adócsalás vádjával 2005-ben ítélték 8 év büntetőtáborra, de 2006 végén újabb vádak kivizsgálására Csitában vizsgálati fogságba helyezték őket. Így azóta az enyhébb büntetőtábor helyett gyakorlatilag szigorított börtönben vannak.

Az új eljárásban egyebek között az 1998-2004 közötti időszakban összesen 896,1 milliárd rubel értékű pénz, illetve kőolaj ellopása, továbbá 487,4 milliárd rubel és 7,5 milliárd dollár tisztára mosása ellenük a vád, s ha bűnösnek találják őket, további 15 év szabadságvesztést szabhatnak ki rájuk. Ezúttal is mindketten ártatlannak vallják magukat.