A hazájában sokak által hősként tisztelt Gotovina - akit a spanyol hatóságok a múlt héten vettek őrizetbe a Kanári-szigeteken - a vádirat szerint irányítója volt olyan horvát katonai akcióknak az 1991 és 1995 közötti horvát-szerb háborúban, amelyekben horvátországi szerbeket öltek meg, illetve űztek el otthonukból. A Knin központú közép-horvátországi Krajina visszafoglalására indított, Vihar nevű 1995-ös hadművelet után mintegy 150 szerb polgári személyt gyilkoltak meg az ő vezetése alatt.

Az ellene felhozott hét vád közül három háborús bűnnek (emberölés,fosztogatás, garázdaság), négy pedig emberiesség elleni bűnnek minősül. Az utóbbiak között sorolták fel az emberek üldözését, deportálását, a velük való kegyetlenkedést.

Akár életfogytig tartó börtönbüntetésre is ítélheti Gotovinát a délszláv háborús bűnök kivizsgálására létrehozott a törvényszék, noha erre eddig csak egy példa volt az NT történetében.